Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms