Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL11A1P12107 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms