Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms