Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHGAP10645 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHGAP10645 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHGAP10645 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHGAP10645 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHGAP10645 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHGAP10645 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHGAP10645 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHGAP10645 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHGAP10645 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHGAP10645 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHGAP10645 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms