Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM10L2BP0DMW5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2BP0DMW5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms