Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIL1P09327 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIL1P09327 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIL1P09327 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIL1P09327 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIL1P09327 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIL1P09327 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIL1P09327 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIL1P09327 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIL1P09327 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIL1P09327 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIL1P09327 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIL1P09327 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIL1P09327 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms