Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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