Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHOP08100 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOP08100 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOP08100 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOP08100 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOP08100 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOP08100 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOP08100 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOP08100 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOP08100 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms