Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB1P08034 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB1P08034 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB1P08034 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB1P08034 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB1P08034 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB1P08034 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB1P08034 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB1P08034 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB1P08034 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB1P08034 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB1P08034 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB1P08034 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms