Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPM2P07951 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPM2P07951 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPM2P07951 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms