Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms