Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGAP02671 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGAP02671 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGAP02671 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGAP02671 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGAP02671 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms