Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EGFRP00533 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EGFRP00533 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EGFRP00533 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EGFRP00533 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EGFRP00533 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EGFRP00533 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EGFRP00533 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms