Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAMTA2O94983 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA2O94983 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms