Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSCO60682 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSCO60682 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MSCO60682 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSCO60682 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSCO60682 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSCO60682 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms