Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GMDSO60547 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GMDSO60547 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GMDSO60547 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GMDSO60547 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GMDSO60547 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GMDSO60547 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GMDSO60547 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms