Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEMFO60524 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEMFO60524 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMFO60524 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEMFO60524 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEMFO60524 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEMFO60524 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEMFO60524 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEMFO60524 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMFO60524 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMFO60524 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms