Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPLO60437 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PPLO60437 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPLO60437 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPLO60437 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPLO60437 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPLO60437 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPLO60437 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPLO60437 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPLO60437 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms