Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH6O60337 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms