Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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