Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOCS1O15524 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS1O15524 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms