Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNPHO15079 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNPHO15079 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNPHO15079 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNPHO15079 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNPHO15079 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNPHO15079 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNPHO15079 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNPHO15079 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNPHO15079 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNPHO15079 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNPHO15079 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNPHO15079 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms