Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TULP2O00295 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TULP2O00295 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TULP2O00295 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TULP2O00295 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP2O00295 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP2O00295 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP2O00295 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms