Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms