Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms