Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L21D6R901 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms