Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms