Protein–RNA interactions for Protein: A6NM11

LRRC37A2, Leucine-rich repeat-containing protein 37A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC37A2A6NM11 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC37A2A6NM11 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC37A2A6NM11 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms