Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms