Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGPEP1LA6NFU8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms