Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms