Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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