Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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CCDC96Q2M329 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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CCDC96Q2M329 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC96Q2M329 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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