Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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