Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIP13Q15645 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms