Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
PSMD6Q15008 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PSMD6Q15008 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.9 ms