Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CUL1Q13616 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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