Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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