Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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TWF1Q12792 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TWF1Q12792 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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