Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AP3M2P53677 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms