Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EPCAMP16422 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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