Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRFP10586 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms