Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SNRK-AS1-201ENST00000422681 750 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms