Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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TCOF1Q13428 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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TCOF1Q13428 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
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TCOF1Q13428 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
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