Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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ITGB3BPQ13352 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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ITGB3BPQ13352 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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ITGB3BPQ13352 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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ITGB3BPQ13352 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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ITGB3BPQ13352 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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ITGB3BPQ13352 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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