Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms