Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP12AP54707 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms