Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TMPOP42166 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TMPOP42166 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TMPOP42166 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TMPOP42166 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TMPOP42166 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms