Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN4AP35499 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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