Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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